Virus HIV, một tầng ngoài cùng là màng bọc virus. Chú thích: env-Glycoprotein Complex là thể phức hợp glicôprôtêin của gen Env, Proteins of Host Cell là prôtêin của tế bào túc chủ, Lipid Membrane là lipít màng, Matrix Protein là prôtêin chất cơ bản, Protease là enzim prôtêin, Reverse transcriptase là enzim phiên mã ngược, Integrase là enzim chỉnh hợp, Viral RNA Genome là bộ gen ARN của virus, Tat, Nucleocapsid là vỏ bọc nhân, Capsid là vỏ bọc.

HIV có cấu trúc không giống với các retrovirus khác. Nó có hình cầu[10] với đường kính khoảng 120nm, nhỏ hơn khoảng 60 lần so với một tế bào hồng cầu, nhưng đối với các virus khác thì nó khá lớn.[11] HIV chứa hai bản sao của ARN chuỗi đơn dương mã hóa 9 gen của virus được bao bọc bởi 1 lớp vỏ (capsid) hình nón bao gồm 2.000 bản sao của các protein p24.[12] Các RNA sợi đơn được gắn kết với những protein nucleocapsid p7 (phức hợp bao gồm acid nucleic và vỏ capsid) và những enzyme cần thiết cho sự phát triển của virus như enzyme phiên mã ngược, enzyme protease, ribonuclease và integrase. Chất gian bào gồm những protein p17 của virus bao quanh lớp vỏ capsid để bảo vệ các hạt virus (virion).[12]